2021年11月29日，南开大学期刊管理中心经第三十九次南开大学党委常委会会议研究决定成立，目前共有《南开学报》（哲学社会科学版）、《南开管理评论》、《南开经济研究》、《文学与文化》、《马克思主义理论教学与研究》、《南开教育论丛》、《电化学与能源科学（英文）》 （英文名：eScience）及姊妹刊《e科学：能源（英文）》（英文名：eScience Energy）、《南开大学学报》（自然科学版）、《离子交换与吸附》、《实验室科学》等期刊。

       其中，《南开学报（哲学社会科学版）》《南开管理评论》《南开经济研究》均为CSSCI来源期刊、北大核心期刊、AMI期刊，《文学与文化》《马克思主义理论教学与研究》为CSSCI扩展版来源期刊，《南开大学学报（自然科学版）》为北大核心期刊、CSCD扩展版来源期刊、中国科技核心期刊，《电化学与能源科学（英文）》为SCI期刊，《离子交换与吸附》为中国科技核心期刊、RCCSE中国核心学术期刊、CACJ中国应用型核心期刊（扩展）。